中国农业大学王少林教授在国际食品控制领域顶级期刊《Food Control》发表研究论文《Occurrence of antimicrobial resistance in lactic acid bacteria from industrial yogurt starters and commercial yogurt products》。
研究以工业酸奶发酵剂与市售酸奶中的乳酸菌、双歧杆菌为研究对象，结合标准化药敏试验、全基因组测序与公共基因组大数据挖掘，系统阐明两类来源菌株的耐药表型差异与耐药基因分布特征，明确耐药基因的基因组环境与潜在水平转移风险，为益生菌与发酵剂菌株的安全评价体系升级提供了全新的科学依据与数据支撑。成果介绍
乳酸菌与双歧杆菌是酸奶发酵与益生菌产品的核心功能菌株，其耐药性及耐药基因向肠道致病菌转移的潜在风险，是全球食品安全领域关注的重点问题。欧盟食品安全局、美国药典委员会等均已明确要求，对发酵用微生物需开展标准化药敏检测与获得性耐药基因评估。目前我国工业发酵剂与市售酸奶中乳酸菌的耐药组、移动组特征仍缺乏系统的基线调查数据，难以支撑安全标准的精细化制定。本研究系统采集 15 份工业酸奶发酵剂与 19 个品牌共 98 份市售酸奶样品，依据国标完成乳酸菌分离纯化，通过生化鉴定、16S rDNA 测序与全基因组平均核苷酸同源性（ANI）分析完成物种鉴定。研究采用 ISO 标准肉汤微量稀释法，测定菌株对 15 种人兽共用临床重要抗生素的最小抑菌浓度（MIC）；结合全基因组测序与 PCR 技术，系统解析耐药基因谱、移动遗传元件与毒力因子；进一步挖掘 NCBI 数据库中 2462 株食用乳酸菌的公开基因组，绘制食用乳酸菌耐药基因全景分布图。耐药表型层面，工业发酵剂来源乳酸菌整体敏感性良好，乳杆菌菌株未表现出获得性耐药特征，双歧杆菌仅存在少量低水平耐药。与之相比，市售酸奶分离株耐药率与多重耐药比例显著升高，四环素、大环内酯类及部分氨基糖苷类耐药现象更为普遍，不同品牌产品间菌株耐药谱存在明显异质性。耐药基因型层面，工业发酵剂乳杆菌基因组中未检出任何获得性耐药基因，符合工业发酵菌株的安全要求；4 株双歧杆菌中检出四环素耐药基因tet(W)，且部分菌株存在基因携带与表型耐药不一致的现象。市售酸奶乳杆菌中检出氨基糖苷类耐药基因aph(3″)-I，为典型的获得性耐药元件。转移风险层面，基因组侧翼序列分析显示，工业发酵剂双歧杆菌的tet(W) 基因旁存在 IS5 家族插入序列 ISBian1，提示该基因具备通过重组发生水平转移的潜在风险；所有受试菌株均未检出已知毒力基因与接合型质粒，菌株核心致病风险处于较低水平。大数据验证层面，对 2462 株公共食用乳酸菌基因组的筛查结果显示，四环素类与大环内酯类耐药基因在食用乳酸菌中分布最广，其中双歧杆菌属的耐药基因携带率显著高于乳杆菌属，从全球尺度印证了食品源乳酸菌是不可忽视的耐药基因储存库。该研究在我国完成了工业发酵剂与市售酸奶乳酸菌耐药性的表型 - 基因型联合系统调查，证实 “标准化 MIC 检测 + 基因组耐药组与移动组分析” 的联合评价模式，可更全面识别传统表型检测遗漏的耐药风险。研究成果不仅为完善我国益生菌与发酵剂安全标准、建立标准化耐药性评价流程提供了关键基线数据，也为防控食物链抗生素耐药性传播、保障发酵乳制品消费安全提供了重要的技术支撑与监管参考。图文鉴赏
Fig. 1. Isolation and identification of lactic acid bacteria and Bifidobacterium from industrial yogurt starters (A) and commercial yogurt products (B).
Fig. 2. Comparison of MDR rates of lactic acid bacteria from industrial yogurt starters and commercial yogurt products.
原文链接
https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2026.112499
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