协同管控重点海域，保障厦门湾渔业生产安全。支队会同厦门、漳州、泉州三市海洋与渔业执法机构，通过签署海上执法协作意见，推动紧密协作与高效配合，厦门湾海域管控措施更实更细。在今年全国两会、国庆假期以及大黄鱼汛期等重点时段，支队联合厦漳泉三市执法力量开展厦门湾海域管控行动5次，全力保障相关海域在重要时段、节点态势平稳可控，有力维护了厦门湾海上渔业生产秩序与安全稳定。
深化闽粤协作机制，彰显省际海上执法协同实效。积极对接广东海洋综合执法机构，进一步落实执法协作机制，加强执法协同联动，深化海上巡查、港口检查。2025年，闽粤两省成功在交界海域开展了4次省际联合执法行动，通过海上联合巡航，重点港口同步“清港查船”等方式，累计出动执法船艇192艘次，检查渔船126艘次，宣传教育渔民2200余人次，查获涉嫌违法违规船舶及未规范管理乡镇船舶146艘，有效遏制了跨界海域的违法违规行为，增强了区域协同治理合力。
凝聚流域执法合力，守护九龙江生态环境。在九龙江流域，支队牵头组织漳州市、龙海区、华安县等渔业执法机构，以及芗城区、南靖县、高新区河长办及流域属地乡镇部门，构建“水陆联动、部门协同”执法格局。2025年，支队组织3次联合编队巡航，综合利用船艇、车辆和无人机巡查，采取夜间、凌晨和周末突击执法方式，查获违法违规船舶5艘，有力打击了破坏渔业资源违法行为，为九龙江流域生物多样性保护和生态环境持续改善提供有力执法保障。
