山西农业大学食品科学与工程学院最早可追溯到1940年铭贤农工专科学校时期的化工科酿造组。1953年开设果蔬贮藏与加工班，1984年成立食品科学系，2001年更名为食品科学与工程学院。2019年省委省政府着眼山西省高等教育和农业科研改革发展大局，决定山西农业大学和山西省农业科学院合署改革，原山西农业大学食品科学与工程学院与原山西省农业科学院农产品贮藏保鲜研究所合署成立新的食品科学与工程学院。学院现在太谷校区和太原龙城校区两个校区办学。
学院现有“食品科学与工程”国家一级硕士学位授权点和食品与营养、生物与医药（食品工程）2个专业硕士授权点，2022年自主设置食品资源与营养工程交叉学科博士点。现招生的本科专业有食品科学与工程（国家级一流本科专业建设点、省优势特色专业）、食品质量与安全（国家级一流本科专业建设点）、葡萄与葡萄酒工程（省级一流本科专业建设点）、食用菌科学与工程（全国首个食用菌本科专业）和食品营养与健康5个本科专业。现有在校生1710名，其中本科生1354名，硕士研究生349名，博士研究生7名。有教职工114名，其中具有正高级职称26人、副高级职称41人，博士生导师17人，硕士生导师88人。学院面向学科前沿，聚焦国家战略，立足山西独特资源禀赋，形成了食品科学、农产品加工及贮藏工程、食品营养、杂粮资源利用与加工（特色方向）4个稳定的研究方向。食品科学与工程连续三年进入软科中国最好学科排名前30%，为山西省重点建设学科。
学院围绕“四个面向”，聚焦“大食物观”和“健康中国”战略，不断强化有组织科研。拥有山西省食用菌产业国家科技特派员创业链、特色农产品加工山西省重点实验室、山西省果蔬贮藏保鲜与加工技术创新中心等十多个国家级、省级科研平台。有全国首批高校“黄大年式”教师团队1支，教育部食品科学与工程类专业教指委委员1人。教师荣获全国师德标兵、全国先进工作者、全国五一劳动奖章、全国脱贫攻坚创新奖等多项国家级荣誉，教工第二党支部入选全国样板支部，院党委被评为山西省先进基层党组织，入选首批省级标杆院系。2025年，学院获批教育部立德树人机制综合改革试点院系建设单位。
学院坚持以立德树人为根本，以培养复合应用型人才为目标，通过认知实习、驻厂实习、科研训练等教学科研实践，构建“产学研”一体化育人模式，其成果《牵劳动教育“牛鼻子”》入选山西省教育厅“2021年大中小学校劳动教育典型案例”。学院年均考研升学率稳定在40%以上，2026年考研升学率为40.76%。学院与澳大利亚蒙纳士大学开展合作办学。1984年以来，学院已为社会培养了大批德才兼备的优秀人才，其中本科生6000余名、硕士研究生1200余名，许多已成为国家及我省相关行业的骨干和中坚力量。
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