研究背景
单倍体诱导(Haploid induction, HI)是加倍单倍体(DH)育种技术的核心环节。DH育种能够使重组单倍型在短短两代内实现完全纯合,极大地缩短了育种周期,相比传统连续自交方法具有显著的时间优势。虽然通过花药或微托离体培养等体外技术可以产生单倍体,但由于这些方法受基因型限制严重、操作复杂且效率较低,难以在多种作物中广泛应用。
近年来,体内单倍体诱导技术取得了突破性进展。在模式植物玉米中,科学家已经成功鉴定出多个关键的诱导基因,包括MATRILINEAL (MTL)(也称为PLA1或NLD)、CENH3、DMP以及过氧化物酶基因ZmPOD65。然而,诱导基因在不同物种间的保守性存在差异。例如,MTL仅在单子叶植物中保守,而DMP介导的诱导机制虽在双子叶植物中得到验证,但在某些物种中的诱导频率仍有提升空间。ZmPOD65作为玉米中新发现的诱导基因,其在双子叶植物中是否具有同样的功能,此前尚缺乏实验证据。

论文概要
中国农业大学园艺学院任华中/刘兴旺团队在Journal of Integrative Plant Biology (JIPB)发表题为“Editing CsPOD7 triggers in vivo maternal haploid induction in cucumber”的论文,揭示了敲除黄瓜中的ZmPOD65同源基因CsPOD7能够成功触发体内母本单倍体诱导。该研究不仅为双子叶植物单倍体育种提供了新的基因靶点,也拓展了过氧化物酶介导的单倍体诱导机制在植物界的应用范畴。
主要研究结果介绍
CsPOD7基因的鉴定与突变体创制
研究人员首先在黄瓜基因组中鉴定了5个ZmPOD65的同源基因,其中CsPOD7(CsaV3_1G008260)与ZmPOD65的亲缘关系最近,蛋白质序列一致性为59.55%。RT-qPCR分析显示,CsPOD7在成熟花药中表现出极高的组织表达特异性,暗示其在雄性生殖发育中发挥重要作用。
为了探究该基因的功能,研究团队利用CRISPR/Cas9技术,在黄瓜品种“长春密刺”背景下创制了Cspod7纯合突变体。实验设计了两个针对CsPOD7第一外显子的sgRNA(图1A)。最终获得了两种突变类型:一种是导致3个氨基酸改变的12-bp替换,另一种是导致单个氨基酸改变的1-bp替换(图1B, C)。此外,载体中整合了由CaMV 35S启动子驱动的EGFP(增强型绿色荧光蛋白)标记,以便后期通过荧光筛选鉴定杂交后代中的单倍体。

Cspod7突变导致生理表型改变
生理生化分析表明,Cspod7突变体的过氧化物酶活性显著低于野生型(WT)。虽然突变体的花粉活力与野生型相近,但其花粉萌发率显著降低了约36%。这种授粉能力的下降直接导致了果实内种子数量的减少,且饱满种子的比例大幅下降,败育种子的比例明显升高(图1D–F)。这一表型特征与已知的多种体内单倍体诱导系(如zmpod65、dmp等)高度相似。
验证CsPOD7的单倍体诱导能力
研究团队首先通过Cspod7-1突变体的自交实验评估其HI潜力。通过流式细胞术对1,739株自交后代进行鉴定,成功发现了3株单倍体植株(图1H, I),而野生型自交后代中未检测到单倍体。
随后,为验证其作为母本单倍体诱导系(即通过雄配子失活诱导母本染色体加倍或发育)的能力,研究者以Cspod7纯合突变体为父本,与7个不同遗传背景的黄瓜种质(包括2个品种和5个纯系)进行杂交。由于突变体携带EGFP标记,而单倍体后代仅含有母本遗传物质,因此不带荧光。利用荧光标记筛选结合流式细胞术鉴定,结果显示其单倍体诱导率(HIR)在0.16%至0.2%之间(图1G-I)。形态学观察发现,这些单倍体植株虽然与二倍体相似,但株型更矮,叶片及花部器官显著变小(图1J–O)。
遗传起源确认与DH系产生
为了确认这些单倍体的母本来源,研究人员对两株单倍体苗进行了全基因组测序。SNP分析证实,单倍体后代中完全不存在父本(Cspod7突变体)的单核苷酸多态性位点,证明其确实源于母本染色体。此外,当以Cspod7作为母本进行杂交,或使用回补品系进行控制实验时,均未产生单倍体,进一步证明单倍体的产生是由父本CsPOD7基因功能缺失驱动的。最后,通过0.1%秋水仙碱处理单倍体胚根,研究团队成功获得了染色体加倍的DH品系,证明了该诱导系在实际育种中的应用价值。
全文总结与展望
本研究首次证明了过氧化物酶基因ZmPOD65的同源基因在双子叶植物中同样具有体内单倍体诱导功能。通过CRISPR/Cas9技术敲除CsPOD7,研究者成功构建了黄瓜母本单倍体诱导系,且该诱导能力不依赖于受体母本的基因型。
尽管目前CsPOD7在黄瓜中的诱导频率(约0.2%)相对较低,但这为双子叶植物DH育种提供了除DMP之外的重要替代方案。未来,研究团队计划通过创制Csdmp Cspod7双突变体,或联合敲除POD家族中的其他冗余成员,进一步挖掘基因间的协同效应,旨在大幅提升黄瓜乃至其他双子叶作物的单倍体诱导效率。这一发现显著丰富了植物体内单倍体诱导的分子工具点,对加速蔬菜作物改良具有重要意义。
研究团队与资助
该研究的第一作者为中国农业大学园艺学院的Sen Li和Shuai Yin。通讯作者为中国农业大学的刘兴旺(Xingwang Liu)教授和任华中(Huazhong Ren)教授。
该项研究得到了国家自然科学基金(32573049, 3202013014)、中国农业大学2115人才发展计划以及111引智计划的资助。
DOI链接:https://doi.org/10.1111/jipb.70276