
2026年3月,日本农业科学研究中心Takuma Ishizaki等人,在Plant Biotechnology Journal发表了题为Rice EMF3 Alleles Adjust Flower Opening Time to Enhance the Seed Setting Rate Under High Temperature Stress的文章。该文章基于图位克隆、基因编辑及转录组测序技术,鉴定了控制水稻开花时间(FOT)的关键基因EMF3,并阐明了其通过花药特异性表达调控开花同步性及耐热性的分子机制。

doi.org/10.1111/pbi.70653
01
EMF3等位基因的育种应用价值
1.规避高温热害:可使水稻在清晨低温时段开花,高温下结实率显著提升。
2.打破杂交障碍:同步籼稻、粳稻及非洲稻的花时,增加花期相遇概率,促进亚种间杂种优势利用。
3.广泛适应性:在IR64、TDK1等主栽品种中导入该基因,能稳定提早开花,且无产量损失。

图1.EMF3的图位克隆、等位基因鉴定及功能验证
02
EMF3等位基因在水稻开花时间中的作用
该研究首次揭示了花药在调控水稻花时中的主导作用,突破了以往仅关注浆片调控花时的认知。EMF3通过半显性方式调控水稻开花时间(FOT),其单核苷酸突变导致的氨基酸改变产生三类FOT变异:提前开花且保持同步性(如emf3-1D)、延迟开花且保持同步性(如emf3-4D)及丧失开花同步性。值得注意的是,EMF3在花药中表达,且对花时基因dfot1呈上位性效应,表明其位于DFOT1上游。

图2.EMF3错义突变产生开花时间的三类表型变异
03
EMF3等位基因突变对种子结实率的影响
EMF3突变对结实率的影响因等位基因类型而异。CRISPR/Cas9敲除突变体因花药开裂受阻,结实率骤降至约10%;而保持开花同步性的突变体结实率可维持80%–90%。在高温胁迫下,携带提早花时等位基因的材料可在温度升至35°C临界阈值前完成开花,通过"热逃逸"策略有效保护结实率。

图3.EMF3高温“热逃逸”实验
04
基因表达与分子机制的探索
EMF3编码一个含723个氨基酸的质膜蛋白,具有Armadillo重复折叠区和四个跨膜片段,属于花药特异性表达的Cluster 2基因群。在提早开花的小穗中,花药内渗透调节基因及细胞壁重塑基因在夜间至清晨显著上调,同时浆片中水转运相关基因亦发生改变,暗示花药信号可能间接协调浆片吸水。此外,该等位基因小穗中茉莉酸含量在夜间即显著高于野生型。综上,EMF3可能通过整合渗透调节、细胞壁动态及茉莉酸代谢等多重途径,从上游协调花药开裂与浆片膨大,从而精准调控开花时间。

图4.EMF3蛋白结构与表达模式
该文章首次揭示了花药通过EMF3基因主动调控水稻开花时间的机制,打破了以往仅关注浆片调控的传统认知。研究建立的EMF3等位基因资源库,为培育规避高温热害的“气候智慧型”水稻及解决亚种间杂交制种难题提供了关键的基因资源和育种策略。
doi.org/10.1111/pbi.70653
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