《林业科学》前沿热点|杨树杂交子代苗期动态生长性状的全基因组选择
杨树作为我国重要的速生用材与生态树种,在木材安全供给和生态建设中具有不可替代的作用。然而,林木童期长、育种周期慢,长期制约着遗传改良效率。传统依赖多年田间表型观测的育种方式,投入大、周期长,已难以满足现代林业对高效育种的需求。在此背景下,南京林业大学陈赢男教授联合本刊编委、中国林业科学研究院胡建军研究员团队的《杨树苗期动态生长性状全基因组选择研究进展》一文中指出,随着高通量测序技术的发展,全基因组选择(GS)为林木复杂性状的早期选择提供了新的技术路径。然而,对于动态生长性状而言,不同发育阶段的遗传效应随时间变化明显,如何选择合适的表型时间点并构建稳定可靠的全基因组选择模型,仍是当前林木全基因组选择应用中的关键问题。
郭臣臣1 李旗1 李思缘1 王泽民2 陈赢男1*韦素云1 胡建军3*
1.南京林业大学林木遗传育种全国重点实验室
南京林业大学南方现代林业协同创新中心
南京林业大学林木遗传与生物技术教育部重点实验室
南京林业大学林草学院
2.江苏省黄海农场有限公司
3.中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种全国重点实验室
本研究利用400株F1杂交子代在4–9 月的动态生长数据(地径和株高)开展GS研究,通过五折交叉验证比较不同月份表型数据以及6 种GS模型对预测准确度的影响;此外,利用生长季结束时(12月)测定的地径和株高数据评估不同GS模型的预测准确度。本研究旨在评估生长季不同阶段的表型数据对GS预测准确度的影响,为优化杨树GS育种技术、加速杨树育种进程奠定基础,同时为其他树种的GS研究提供借鉴和参考。
表型统计结果显示,400株杂交子代在苗期表现出显著的个体差异。地径变异系数为0.23–0.34,株高变异系数为0.18–0.54。同时,基于GCTA估算的狭义遗传力表明,地径遗传力在不同月份变化较小(0.42–0.51),株高遗传力随发育阶段变化更为明显(0.39–0.63)。这表明地径的遗传效应相对稳定,而株高对发育阶段和环境更为敏感。
苗期早期(4–5月)测定的地径和株高与生长季结束(12月)的最终表型相关性较低,难以充分反映稳定的遗传差异。随着生长季推进,6–9月表型与最终性状的相关性显著增强,基于该阶段表型构建的GS模型预测准确度明显提高。其中,地径在生长季中期即可获得较高的预测效果,而株高在生长季后期表现最佳。这表明,生长季中后期表型更有利于生长性状的GS模型构建。
9月表型结合BayesA模型可实现苗期有效优良子代筛选
在多种GS模型比较中,参数模型整体表现优于机器学习模型,其中BayesA模型在不同生长阶段均表现出较高稳定性。基于9月表型构建的BayesA模型在地径和株高预测中取得最高准确度,并能够在苗期阶段识别出与最终实测表型高度一致的优良子代。结果表明,GS能够在一定程度上替代表型选择,为早期育种决策提供依据。
本研究基于连续月份的动态生长数据,系统评估了不同表型时间点和不同模型对杨树苗期GS预测效果的影响。结果表明,生长季中后期表型更有利于构建高精度GS模型,其中9月表型结合BayesA模型表现最优。研究验证了GS在苗期筛选优良子代中的可行性和可靠性,为缩短杨树育种周期、提升遗传改良效率提供了有效方法。
郭臣臣,李旗,李思缘,王泽民,陈赢男*,韦素云,胡建军*. 2026. 杨树杂交子代苗期动态生长性状的全基因组选择. 林业科学,62(1): 32-41.
责任编辑:万贤崇
朱乾坤
图文制作:张羽彤
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