无锡渔业学院由南京农业大学与中国水产科学研究院淡水渔业研究中心在长期联合办学的基础上创办，经原国家教委和农业部批准于1993年成立，隶属于南京农业大学动物科学学部，是国内最早进行校所联合办学、协同育人的成功实践成果。
学院成立33年来，在“以科促教，以教强科，科教共进”方针指引下，始终坚持科教协同育人机制，充分发挥合作办学优势，以大团队、大平台、大项目支撑高质量人才培养。2017年，在教育部发布学科评估中水产学科整体水平位于全国第六；2018年，获第三届中国学位与研究生教育学会研究生教育成果奖二等奖；2021年，水产学科在泰晤士中国高等教育学科评级获得A+；2022年，无锡渔业学院研究生团队相继获第八届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛江苏省赛冠军、全国选拔大赛红旅赛道金奖。
学院现有水产学一级学科博士授权点，拥有水产养殖学和水生生物学两个博士授权点，水产、渔业资源、农业（渔业发展）3个硕士学位授权点、1个水产博士后科研流动站和3个企业博士后科研工作站，具有完善的人才培养体系。
学院共有研究员29人，副研究员48人，其中有国务院学位委员会水产学科评议组成员1人，享受政府特殊津贴、突出贡献专家19人，百千万人才工程国家级人选1人，全国农业科研杰出人才4人，国家现代农业产业技术体系首席科学家1人，中国水产科学研究院首席科学家4人，岗位科学家11人。博士生导师14人，硕士生导师45人。
学院以可持续水产养殖、渔业产业现代化为发展导向，不断开拓创新，先后建有生物技术、遗传育种、水产养殖、水环境科学等8个教研室；拥有农业农村部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室、农业农村部水产品质量安全环境因子风险评估实验室（无锡）等10多个部省级高端科研创新平台。依托5个校内科研试验基地及6个稳定的校外教学实践基地，构建了“实验室+科研创新平台+校内实践基地+校外生产企业”的产学研紧密结合的渔业领域实验实践教学平台。
无锡渔业学院是国内将教育、人才及科研资源深度融合、培养行业拔尖创新人才最早的尝试者，是中国新农科建设的较早实践者，充分利用中国水产科学研究院淡水渔业研究中心的国家级科研院所优势，支撑水产学科发展的合作模式，开创了产学研合作的探索之路。
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