对怀孕母猪及其胎猪进行单细胞测序,获得256万细胞,涵盖76种主要细胞类型与412种内皮亚型。该图谱揭示了不同器官间细胞的转录组差异,为后续分析提供了统一的遗传背景参照(图1)。
图1:两个猪家族中“全整合”单细胞全景图概览
血管内皮细胞在脑与外周器官间呈现显著的增殖、免疫和代谢差异。脑内皮下调MHCⅡ类分子与CD36,而外周则高表达。证明内皮细胞的功能特征具有器官特异性,受局部微环境影响(图2)。
图2:构建“一站式”单细胞图谱及胎儿与成年猪全身器官内皮细胞景观特征分析
依据标志基因将内皮分为动脉、毛细血管、静脉等亚型,并识别出多个功能特化亚群。部分毛细血管亚型富集免疫调节或代谢相关基因。该分类体系为解析血管功能异质性奠定了基础(图3)。
图3:59个器官中内皮细胞的器官内异质性及免疫调节功能多样性
鉴定出355个胎猪和407个成年母猪的细胞类型特异转录因子,其中IRX6为小胶质细胞特异性因子,在11个脑区中高度保守。证明了单一个体图谱可准确识别组织细胞类型特异的转录调控因子(图4)。
妊娠晚期心脏出现Cap2毛细血管亚型,高表达脂肪酸转运基因,低表达葡萄糖转运基因,该亚型在产后恢复至非孕水平。证明妊娠期心脏通过内皮亚型转换实现能量代谢的适应性调整(图5)。
图5:猪心脏在NP、LP和PP状态下的动态细胞与功能适应性变化
生长受限胎猪的滋养层中氨基酸转运体SLC1A5和SLC38A2表达下调,导致血清L-亮氨酸减少,肌肉中一种II型肌纤维亚群比例下降。证明滋养层氨基酸转运障碍是限制胎儿肌肉发育的关键环节(图6)。
整合猪、人、小鼠15种器官的单细胞数据,发现免疫、上皮、基质及脑细胞类型在转录组上高度保守。Cap2内皮亚型及SLC1A5在人与猪中表达模式一致。证明了猪可作为研究妊娠适应与FGR的可靠模型(图7)。
图7:比较分析显示猪、人类和小鼠之间存在细胞类型及基因表达程序的跨物种保守性