Hortic Res 综述 | 安徽农业大学岳俊阳团队系统总结猕猴桃基因组学发展历程与未来方向

从本土野生资源到全球畅销水果，从单一基因组到超级泛基因组——猕猴桃这本在华夏大地谱写序章的“生命之书”，正被一页页翻开。它不仅是广为人知的“维C之王”，更凭借其雌雄异株（XY/XX）与复杂多倍性（2x–10x）的独特遗传架构，成为探究植物性别进化、多倍体适应性以及实施现代分子育种的理想体系。自本世纪初以来，高通量测序技术的迭代革新，推动了猕猴桃基因组学研究范式的根本转变，使得在组学层面深入解析其起源、驯化与重要性状形成的动态遗传机制成为可能。

2026年第5期，Horticulture Research上线了（Advance Access）安徽农业大学园艺学院联合新西兰生物经济研究院、西北农林科技大学、中国农业科学院果树研究所、中国农业科学院郑州果树研究所、中国科学院武汉植物园等多家单位合作完成的题为“Kiwifruit genomics and applications: recent advances, current challenges and future prospects”的长篇综述。该综述全面梳理了猕猴桃基因组学领域发展历程中的关键突破，内容涵盖从首个参考基因组发布到超级泛基因组构建的技术演进、从多组学整合到基因编辑应用的方法创新、从关键基因发掘到调控网络构建的理论突破，并系统展望了全基因组选择与智能设计育种的发展方向，旨在为后续研究与育种工作提供完整的知识图谱和路线参考。

一、基因组组装：从“0到1”到“1到N”的跨越

自2013年猕猴桃基因组HongyangV1发布以来，相关研究便与测序技术的迭代同步推进，直至2022年成功构建首个“端粒至端粒”的单倍型基因组HongyangV4，标志着猕猴桃研究正式迈入“T2T时代”。与此同时，国内外研究团队相继发布了包括中华猕猴桃、毛花猕猴桃、软枣猕猴桃等多个物种的高质量基因组，逐步建立起覆盖猕猴桃属主要类群的数字资源库，为后续比较基因组学与泛基因组分析奠定了坚实基础。

二、数据库建设：从“数据孤岛”到“共享中枢”的演进

伴随着基因组数据的爆炸式增长，猕猴桃专属数据库的建设也实现了从单一资源库到综合性知识平台的跨越。早期的KIR与KGD收集基因组与转录组信息，奠定了数据共享基础。而最新发布的KPGD则进一步集成33个基因组的55套单倍型组装，同时融合了多组学数据资源，并提供CRISPR设计、变异检测、富集分析等在线工具，构建了一个贯通基础研究与育种应用的“一站式”平台，为全球猕猴桃研究人员提供了高效协作与创新的“科研GPS”。

三、多组学联动：从“基因序列”到“表型特征”的解码

在基因组图谱与数据库体系的双重支撑下，转录组学、蛋白组学、代谢组学及表观组学等多组学手段得以系统应用，形成了从基因序列到表型特征的完整解析链条。研究表明，猕猴桃关键农艺性状通常受到复杂的多基因调控网络控制。例如，通过整合转录组与代谢组数据，科研团队成功揭示了猕猴桃红色果肉形成的调控路径；在抗病研究方面，多组学数据的整合使得从系统层面揭示猕猴桃对Psa的防御响应机制成为可能。

四、AI育种赋能：从“经验选择”到“模型驱动”的转变

随着CRISPR-Cas9等基因编辑技术的成熟，猕猴桃功能基因组学研究进入了“靶向设计”新阶段。科研团队先后实现了对开花时间、性别决定等关键基因的精准编辑，并成功创制出早花材料。同时，图谱泛基因组的构建进一步揭示了猕猴桃属内丰富的结构变异，为分子标记开发、全基因组选择与智能设计育种提供了基础数据。

综上，本文是对猕猴桃基因组学奠基与演进之路的系统性梳理与前瞻性展望，既展示了我国在该领域的深厚积淀与引领地位，也为全球猕猴桃科研和育种工作提供了全局性发展蓝图。面向未来，研究强调需进一步加强跨物种多组学数据整合、开发高效遗传转化体系、构建人工智能驱动的表型-基因型预测模型，以期实现从“理解生命”到“设计生命”的跃迁，从而推动猕猴桃育种全面迈入精准化、智能化、高效化的“育种5.0”新纪元。

安徽农业大学园艺学院硕士研究生Malik Umair Faiz、刘鑫和孙嘉瑞为该论文的共同第一作者，岳俊阳副教授为论文的通讯作者，合作单位的多位老师和学生参与了本课题的相关工作。该研究获得了国家自然科学基金、安徽省自然科学基金、安徽农业大学高层次人才启动经费等多个项目的支持。

文章链接：

https://doi.org/10.1093/hr/uhag024

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