2025年百项重大农业科技成果 | 万相育种加速器-结合超低覆盖度全基因组测序和深度学习的多组学可解释基因组选择平台

本技术成果基于自主研发的超低覆盖度测序体系与一键式基因型分析流程，突破传统依赖进口基因芯片的基因型分型瓶颈，首次在测序深度低至0.1X、样本数少于10、参考群体不足百例的严苛条件下，实现了目前准确率最高的全基因组SNP分型(准确率可达97%以上)，支持早期种质选择及优质胚胎筛选，相关成果发表在在世界排名前7%的综合性期刊《AdvancedScience》(IF5=16.3)。结合多组学数据（如ATAC-seq、STARR-seq等）构建可解释的深度学习模型，提升了复杂性状预测的准确性与因果变异定位能力，实现了从分型、建模到选育推荐的全流程国产自主平台搭建。