东北农业大学植物保护学院的历史可追溯至1958年设立的植物保护专业，办学历史较为悠久。2022年独立建院后，学院发展迈入快车道，现设有农业昆虫、植物病理、农药3个系，拥有植物保护、生物农药科学与工程两个本科专业。其中，生物农药科学与工程专业为2026年获批的新专业。目前，学院形成了本-硕-博完备的人才培养体系。植物保护一级学科在农业昆虫与害虫防治、植物病理学和农药学3个二级学科招收硕士和博士研究生，同时在资源利用与植物保护领域招收专业硕士。
学科专业实力突出，平台支撑有力。植物保护学科为黑龙江省重点学科和“双一流”建设学科，植物保护专业是国家一流专业建设点。学院拥有黑龙江省农业微生物重点实验室、黑龙江省寒地作物有害生物绿色防控重点实验室2个省级科研平台，拥有植物科学与技术国家级实验教学示范中心（植物保护实验中心），以上科研和教学平台为人才培养与科研创新提供坚实保障。
师资力量雄厚，名师引领发展。学院现有教职工65人，其中专任教师55人，教授13人、副教授17人，博士生导师13人、硕士生导师35人。拥有国家级人才6人次、省部级人才28人次，多人荣获“全国模范教师”“全国先进工作者”“教育部课程思政教学名师”“黑龙江省教学名师”等荣誉称号，具有“农业昆虫与害虫防治”“植物病理学”“农药学”3个省级专业技术领军人才梯队。
科研实力强劲，成果服务社会。近5年，学院承担科研项目450项，到账经费1.09亿元， 获国家自然科学基金重点项目3项、优秀青年基金项目1项；获省部级以上科技奖励10项，其中黑龙江省科技发明一等奖2项；领衔黑龙江省“头雁”团队， 获批经费4000万元。多项成果实现转化应用， 其中谷维菌素转让金额达5000万元；大豆主要害虫生物防治技术累计示范推广1000余万亩，新增经济效益8.41亿元，为地方农业发展作出重要贡献。
人才培养特色鲜明，注重产学研融合。学院以国家行业需求为导向，培养具备植物病虫草害识别诊断、预测预报、综合防治等能力的高素质人才。与多家企业深度合作，为学生提供丰富实习就业机会。积极开展国际交流，拓宽学生视野；重视创新创业教育，强化实践能力，致力于培养能够解决农业生产植保问题的专业人才。
