基本信息

近日,蛋鸡体系配套系选育岗位专家、中国农业大学张浩教授团队在国际期刊 Advanced Science 发表研究论文《大规模基因组分析揭示藏鸡三族系来源及高原适应分层演化机制》(Large-Scale Genomics Reveals Three-Source Ancestry and Layered Adaptation to High Altitude in Tibetan Chickens),通过1054份全基因组进行分析,系统揭示了藏鸡高原适应中多个祖源在时间及功能上的分层贡献机制。

研究背景

藏鸡是青藏高原重要的地方特色禽种资源,其低氧耐受、耐粗饲、适应性强等特性突出,是研究家养动物高原适应的理想模型,也是高原特色养殖和地方品牌建设的重要基础。然而不同祖源的迁移输入、发生时间及功能后果如何共同塑造这一适应机制,目前仍知之甚少。

主要结果

研究解析出三个不同的祖源——中国西北(NWC)、川滇毗邻地区(SYA)和喜马拉雅山麓南部(SHF),它们的贡献在时间上呈分层结构:NWC构成最深层的奠基层(>928代),SHF记录了一个古老但低强度的信号(约928代,95%CI 875–1024),SYA则反映了近期的一次主要扩张(约514代,95%CI 493–541),并伴随阶梯式扩散跨越高原。

图1. 藏鸡三来源祖源模型
本研究中,基于人口统计学零模型校准的选择扫描显示,三类祖源在功能类别上存在差异富集:NWC与血管稳态和凝血相关(如 VWF、TSPAN9),SYA与钙信号传导和代谢调控相关(如 CACNA2D1、AMY2A),SHF则与肺血管重塑相关(如 AGTR1)。

图2. 三类祖源的功能互补与选择信号
该研究为藏鸡优异基因资源的保护与利用提供了系统的遗传图谱,相关结果可为高原特色家禽精准育种、抗逆性状改良与种质创新提供参考,也为蛋鸡体系挖掘利用地方品种抗逆基因、培育适应特殊环境的配套系提供了新思路。
|来源:国家蛋鸡产业技术体系
原标题:科研进展 | 大规模基因组分析揭示藏鸡三族系来源及高原适应分层演化机制
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