https://doi.org/10.1186/s43897-025-00215-6
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近日,Molecular Horticulture在线发表了河南农业大学园艺学院冯建灿、谭彬教授团队的最新研究成果,题为LncRNA7503 decreases peach (Prunus persica) branch number and angle by inducing pre-miR395a degradation and reducing bioactive BR content。该研究首次揭示了桃树(Prunus persica)中一个由长链非编码RNA、microRNA和激素代谢共同调控分枝数与分枝角度的分子模块,为桃树树型改良与省力化栽培提供了新靶点。
背景介绍
桃树树型,不只是“颜值”问题
桃树的分枝数量和角度,直接决定了树冠的大小与形态,进而影响果园管理难度、果实产量与品质。柱型桃是桃资源中的一类特异种质,因其分枝角度小、树冠紧凑,是研究桃树型的理想材料。
研究结果
lncRNA-miRNA如何影响活性BR含量?
研究团队通过对柱型桃‘照手红’与普通型桃‘大久保’的 miRNA 与 lncRNA、mRNA测序分析,发现了一个关键基因:PpCYP734A14,它参与油菜素内酯(BR)的代谢过程,能将活性BR转化为无活性形式。进一步研究发现:miR395a-3p可直接靶向并降解PpCYP734A14的mRNA,从而提升活性BR含量;而lncRNA7503则像一位“隐形调控者”,通过与pre-miR395a结合并诱导其降解,减少成熟miR395a-3p的数量,间接提升PpCYP734A14的表达,降低活性BR含量(Fig.1)。
Fig.1 LncRNA7503结合并降解miR395a的前体序列进而上调BR代谢基因PpCYP734A14的表达。
提出模型:一个调控桃树树型的“分子开关”
研究最终构建了一个清晰的调控通路:柱型桃中高水平的lncRNA7503使pre-miR395a(miR395a-3p的前体)降解,截断来源。成熟的miR395a-3p数量大幅减少,它无法有效切割其靶基因PpCYP734A14,因此,PpCYP734A14的表达水平持续偏高,PpCYP734A14蛋白是一种BR降解酶,使活性BR被大量“灭活”,最终,桃树体内的活性BR含量降低,低水平的活性BR抑制了腋芽的萌发与生长(分枝数减少),同时也抑制了分枝角度,最终表现为柱型桃的典型特征:分枝少、分枝角度小(Fig.2)。普通型桃中,lncRNA7503表达量低,进而产生大量成熟的miR395a-3p,丰富的miR395a-3p有效地识别并切割PpCYP734A14的mRNA,使其表达水平维持在低位,由于BR降解酶(PpCYP734A14)很少,活性BR得以大量积累。最终,桃树体内的活性BR含量升高,高水平的活性BR促进了腋芽的萌发和枝条的生长(分枝数增多),并促使枝条以更开张的角度生长(分枝角变大),最终表现为普通型桃的典型特征:分枝多、分枝角度大(Fig.2)。
Fig.2 lncRNA7503-miR395a-PpCYP734A14调控桃分枝模式图。
从“读懂树木”到“设计树型”
这项研究成功地描绘了一个完整的“lncRNA → miRNA → 功能基因 → 激素代谢 → 植物表型”的调控轴。LncRNA7503 扮演了“总开关”的角色,通过调控下游的miRNA,精细地调节着油菜素内酯的活性水平,最终决定了桃树的树型。这不仅是一个基础研究的突破,更为我们未来通过基因技术或分子标记辅助育种,定向改良果树树型、实现省力化栽培,提供了清晰的靶点和可行的路径。
河南农业大学副教授王小贝和毕业研究生谢贺芳(现博士就读于西北农林科技大学)为共同第一作者,冯建灿教授和谭彬教授为共同通讯作者。该论文得到国家自然科学基金(32202412)、河南省高等学校重点科研项目(24ZX010)、2024年河南省引智专项项目(GZS2024005)、河南省大宗水果产业技术体系桃育种栽培岗位专家项目(HARS-22-09-G1)的资助。
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