河南农业大学引进高层次人才、特聘教授顶级期刊(IF=15.6)发表重要研究成果,填补L了中国跨境迁徙候鸟微生物参考基因组和基因集研究盲区

      中国地处东亚—澳大利西亚、中亚和西亚—东非等重要候鸟迁徙路线的交汇区，是候鸟停歇、繁殖和越冬的关键区域。然而，候鸟在长途迁徙过程中，也成为了微生物乃至耐药基因的携带者和传播者。      研究团队整合分析52种鸟类的宏基因组测序数据，组装获得了5823个高质量MAGs，其中约50%的MAGs未被描述过，覆盖36个门、1709个潜在新物种，拓展了我们对候鸟携带“微生物暗物质”的认知。在功能基因挖掘方面，预测到15678个次级代谢产物生物合成基因簇（BGCs），其中核糖体合成肽类（RiPPs）和非核糖体肽合成酶类（NRPS）最为丰富，为新型抗菌肽和天然产物的开发提供了重要数据资源。      研究团队在候鸟肠道微生物中识别出1814种抗生素耐药基因，绘制了52种鸟类的耐药基因图谱，包括碳青霉烯、多黏菌素、替加环素和恶唑烷酮等优先药物耐药基因，耐药基因的跨物种、跨区域（大洲、国家）、跨生境的传播风险严峻。 

图 候鸟跨境迁徙路线图

      研究团队为10种鸟类佩戴了GPS追踪器，累计获取超过10万个高精度定位点。追踪数据显示，这些候鸟从云南等地，向北迁徙至俄罗斯、蒙古，或向西进入印度、孟加拉国、缅甸等地，途经中国江西、河南、黑龙江、新疆、青海、西藏、内蒙古、甘肃、宁夏等多个省份。      该研究范围覆盖中国11个省份、52种鸟类，核心价值在于多生态位、多鸟种、多年度尺度上构建的大规模迁徙候鸟微生物组参考数据集，填补了中国跨境迁徙候鸟微生物参考基因组和基因集研究盲区，构建的MBGG目录将成为全球科研人员挖掘候鸟微生物资源“暗物质”、研究耐药基因传播机制和评估公共卫生风险的重要工具。      河南农业大学动物医学院国家动物免疫学国际联合研究中心王亚楠（河南农业大学高层次人才、特聘教授、博士生导师/硕士生导师）为论文唯一通讯作者，河南农业大学动物医学院国家动物免疫学国际联合研究中心为第一完成单位。王亚楠与中国科学院昆明动物研究所（遗传进化与动物模型全国重点实验室）伍和启为论文共同第一作者。中国科学院微生物研究所高福院士、朱宝利研究员、毕玉海研究员，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所徐子乾副研究员，上海市疾病预防控制中心许学斌教授等参与指导了研究。该研究得到了国家重点研发计划、河南农业大学高层次人才、中国科学院生物多样性监测与研究网络-鸟类专项等项目的资助。      论文链接：https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.74581