棉苗在15ºC以下，易遭病害侵袭；棉种发芽后，如果温度下降到10℃以下，易造成低温冷害。温度降到0-5℃时会出现冻害。当出现冻害棉苗初生的幼根会发生碳水化合物和氨基酸外渗，导致皮层崩溃而根尖死亡，即使随后温度回升，也只能在下胚轴基部生出次生根。
棉籽一般在12℃时需10天左右，13℃时需要一周左右，16℃时需要5天，20～30℃时只需2—3天就可以出苗。
出苗和形成第一片真叶：14-17ºC以上；
种子萌发的条件：
1、水分：萌发吸足种子重量的60%水分
2、温度：发芽出苗的起点温度为10.66ºC， 变温条件（低温播种，高温出苗）有利棉籽发芽。出苗需要16~18ºC的最低极限温度。
3、氧气 ：萌发过程中，水解脂肪和蛋白质所需的氧气高于糖的4倍；
播种后怎么看种子状态呢？挖开种穴可以看到种子处于半萌半干状态，这种情况是地墒不匀，有些地方棉种吸胀后达不到萌芽条件，出现的回芽情况。掰开棉种可以看到有些种子露白了，但根尖发黄且有萎蔫现象。有些棉种胚里有一半子叶还没开始分层的，这就更能说明墒不匀。如果这种情况占的比例大，后期就需要重新播种。还有种情况和它类似，但种子子叶还没有分层，有些还没有吸胀。只是有些花墒，或在高坡或土质不匀的沙地上，或是盐碱大的条田出现了假墒。这种情况避开低温抓紧时间补水，水少润湿种孔就好。
未播种、未出土棉田需要注意什么？
（1）依据天气预报情况，适当调整播种期，避过低温期，做到冷尾播种，暖头出苗。
（2）播种前还是要加强种子二次拌种处理，提高发芽势在这几天还是很重要的。
（3）雨雪墒大，播种后48小时内必须滴水，同时提高播种质量，增加采光面，目的是缩短棉种萌发时间。
（4）棉种露白且还没拱土棉苗，目前看墒很大的，种穴内土壤能捏出明水，这种情况必须加强播后中耕。中耕深度12-15厘米，宽度20-30厘米，三根杆尺为宜，土壤湿度大中耕深度加深，深度越深宽度要窄些。
（5）墒大未出苗棉田暂时不宜补水带肥，但要密切关注种孔土层变化，一旦发现种孔有裂口需及时补水。
如果播种时间正常，土壤湿度达到要求，却发现大多数种子在土壤中仍处于休眠状态，剥掉种皮发现种胚颜色并不是乳白色，而是呈棕黄色或黄色，表明种子有问题。
如果播种时间适宜，种子在土壤中仍处于休眠状态，剥开种皮查看其颜色正常且有未吸足水分的表现，说明土壤墒情不足，应当及早采取措施。
前者属于种子质量低劣应抓紧重播，而后者是属于土壤水分不能满足种子发芽出土需要，应采取补墒的办法。
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