Plant Com | 北大现代农业研究院周军会/何航团队与上海交大连红莉团队在树莓糖积累研究中取得重要进展

DOI: 10.1016/j.xplc.2026.101849

2026年4月10日，北京大学现代农业研究院周军会团队、何航团队与上海交通大学连红莉团队在 Plant Communications 在线发表题为 Two telomere-to-telomere genome assemblies and comparative genomics reveal the conserved "toolkit" genes associated with sugar accumulation in Rubus genus 的研究论文。该研究通过构建蓬蘽（XMM）与大红泡（DHP）两个端粒到端粒（T2T）无缺口参考基因组，结合比较基因组学、转录组学、代谢组学及瞬时过表达与沉默实验，系统揭示了悬钩子属果实中糖转运蛋白相关基因RhSTP13、RhSTP7和RhMFS1协同调控糖分输入、输出与稳态的分子机制。

悬钩子属（Rubus）是蔷薇科重要浆果类群，包含740余个物种，兼具重要经济价值与科研价值。其果实富含多种活性成分，在营养、保健和药用方面潜力突出，但由于物种多样、基因组高度杂合且倍性复杂，现有基因组组装普遍存在碎片化严重、着丝粒和端粒区域不完整等问题，制约了果实风味等重要性状分子机制研究。针对这一难题，北京大学现代农业研究院周军会团队和何航团队合作，围绕悬钩子属高质量基因组组装及糖积累机制开展系统研究，为相关功能基因挖掘和分子育种提供了重要基础。

图1 蓬蘽（XMM）与大红泡（DHP）从头基因组组装、比较基因组学与转录组学揭示悬钩子属果实糖积累候选“工具包”基因

此外，研究团队构建了悬钩子属数据库RubusDB（http://www.rubusdb.cn），整合了多套基因组、转录组以及34项表型数据，并提供BLAST、批量查询等基础分析工具，为悬钩子属资源保存、基因挖掘和功能研究搭建了开放共享的平台。

研究意义

该研究不仅获得了目前最完整的悬钩子属T2T基因组资源，也从基因组到功能验证层面系统解析了果实糖积累相关“工具基因”的作用机制，为悬钩子属风味品质形成研究、优异种质创制和分子设计育种奠定了坚实基础。

研究团队

北京大学现代农业研究院/潍坊现代农业山东省实验室周军会研究员、何航研究员与上海交通大学连红莉教授为该文共同通讯作者；北京大学现代农业研究院李晓鹏、韩先焱（北京大学现代农业研究院与中国农业科学院联合培养博士生）、刘守成助理研究员（现北京大学现代农业研究院与厦门大学联合培养博士生）、贵州植物园张群英研究员、官纪元助理研究员为该文共同第一作者。北京大学现代农业研究院郑孟卓、唐雅君博士、卞建新博士、李奎博士、王征东博士，上海交通大学许鹏博副研究员，中国农业科学院郑州果树研究所周厚成研究员，东北农业大学杨国慧教授为本研究做出了重要贡献，感谢北京大学现代农业研究院高性能计算平台提供的算力支持。本研究得到了山东省泰山学者项目、北京大学现代农业研究院院长基金、潍坊现代农业山东省实验室以及贵州省科技计划项目的资助。

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